MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 88804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011080	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
2	NC_011080	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	194446390
3	NC_011080	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
4	NC_011080	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
5	NC_011080	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	194446390
6	NC_011080	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
7	NC_011080	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	194446390
8	NC_011080	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
9	NC_011080	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
10	NC_011080	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
11	NC_011080	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	194446390
12	NC_011080	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	194446390
13	NC_011080	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
14	NC_011080	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
15	NC_011080	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
16	NC_011080	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446390
17	NC_011080	GCC	2	6	967	972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
18	NC_011080	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
19	NC_011080	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
20	NC_011080	CTG	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
21	NC_011080	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	194446390
22	NC_011080	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446390
23	NC_011080	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446390
24	NC_011080	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
25	NC_011080	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
26	NC_011080	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
27	NC_011080	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
28	NC_011080	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194446390
29	NC_011080	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	194446390
30	NC_011080	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
31	NC_011080	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
32	NC_011080	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
33	NC_011080	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446390
34	NC_011080	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446390
35	NC_011080	CAATAT	2	12	1605	1616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	194446390
36	NC_011080	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446390
37	NC_011080	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446390
38	NC_011080	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446390
39	NC_011080	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194446390
40	NC_011080	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
41	NC_011080	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
42	NC_011080	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194446390
43	NC_011080	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
44	NC_011080	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446390
45	NC_011080	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446390
46	NC_011080	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
47	NC_011080	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446390
48	NC_011080	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
49	NC_011080	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
50	NC_011080	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
51	NC_011080	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	194446390
52	NC_011080	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	194446390
53	NC_011080	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
54	NC_011080	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	194446390
55	NC_011080	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446390
56	NC_011080	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446390
57	NC_011080	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
58	NC_011080	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	194446390
59	NC_011080	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446390
60	NC_011080	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446390
61	NC_011080	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446390
62	NC_011080	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446390
63	NC_011080	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444692
64	NC_011080	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444692
65	NC_011080	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	194444692
66	NC_011080	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444692
67	NC_011080	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444692
68	NC_011080	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	194444692
69	NC_011080	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444692
70	NC_011080	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
71	NC_011080	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444692
72	NC_011080	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444692
73	NC_011080	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444692
74	NC_011080	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
75	NC_011080	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	194444692
76	NC_011080	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444692
77	NC_011080	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
78	NC_011080	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	194444692
79	NC_011080	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	194444692
80	NC_011080	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444692
81	NC_011080	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444692
82	NC_011080	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444103
83	NC_011080	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	194444103
84	NC_011080	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444103
85	NC_011080	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444103
86	NC_011080	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	194444103
87	NC_011080	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
88	NC_011080	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
89	NC_011080	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	194444103
90	NC_011080	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444103
91	NC_011080	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	194444103
92	NC_011080	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
93	NC_011080	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444103
94	NC_011080	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444103
95	NC_011080	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
96	NC_011080	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444103
97	NC_011080	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444103
98	NC_011080	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
99	NC_011080	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	194444103
100	NC_011080	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	194444103
101	NC_011080	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	194444103
102	NC_011080	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194444103
103	NC_011080	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
104	NC_011080	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	194444103
105	NC_011080	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444103
106	NC_011080	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444103
107	NC_011080	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	194444103
108	NC_011080	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444103
109	NC_011080	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444103
110	NC_011080	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	194444103
111	NC_011080	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444103
112	NC_011080	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444103
113	NC_011080	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	194443561
114	NC_011080	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443561
115	NC_011080	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443561
116	NC_011080	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443561
117	NC_011080	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	194443561
118	NC_011080	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	194443561
119	NC_011080	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443561
120	NC_011080	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443561
121	NC_011080	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443561
122	NC_011080	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443561
123	NC_011080	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	194443561
124	NC_011080	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	194443561
125	NC_011080	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443561
126	NC_011080	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	194443561
127	NC_011080	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443561
128	NC_011080	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443561
129	NC_011080	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443561
130	NC_011080	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	194443561
131	NC_011080	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	194442782
132	NC_011080	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442782
133	NC_011080	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442782
134	NC_011080	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442782
135	NC_011080	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	194442782
136	NC_011080	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
137	NC_011080	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
138	NC_011080	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442782
139	NC_011080	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442782
140	NC_011080	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
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142	NC_011080	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	194442782
143	NC_011080	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	194442782
144	NC_011080	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442782
145	NC_011080	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	194442782
146	NC_011080	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
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148	NC_011080	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194442782
149	NC_011080	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442782
150	NC_011080	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442782
151	NC_011080	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	194442782
152	NC_011080	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442782
153	NC_011080	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	194442782
154	NC_011080	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442782
155	NC_011080	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442782
156	NC_011080	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442295
157	NC_011080	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	194442295
158	NC_011080	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
159	NC_011080	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
160	NC_011080	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	194442295
161	NC_011080	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
162	NC_011080	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194442295
163	NC_011080	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	194442295
164	NC_011080	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442295
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168	NC_011080	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	194442295
169	NC_011080	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442295
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172	NC_011080	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	194442295
173	NC_011080	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442295
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194	NC_011080	TGG	2	6	9879	9884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446224
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233	NC_011080	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	194444220
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240	NC_011080	ATC	2	6	12095	12100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194444220
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243	NC_011080	TAT	2	6	12202	12207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444220
244	NC_011080	CGA	2	6	12214	12219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444220
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246	NC_011080	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	194444220
247	NC_011080	GTG	2	6	12276	12281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444220
248	NC_011080	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	194444220
249	NC_011080	AAG	2	6	12381	12386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444220
250	NC_011080	TCT	2	6	12413	12418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444220
251	NC_011080	GCA	2	6	12421	12426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444220
252	NC_011080	ACG	2	6	12597	12602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444220
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254	NC_011080	A	6	6	12644	12649	100 %	0 %	0 %	0 %	194444220
255	NC_011080	GCG	2	6	12729	12734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444220
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259	NC_011080	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	194444220
260	NC_011080	TGC	2	6	12912	12917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444220
261	NC_011080	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	194444220
262	NC_011080	AGA	2	6	13083	13088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444220
263	NC_011080	TCT	2	6	13103	13108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444220
264	NC_011080	GAA	2	6	13121	13126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444220
265	NC_011080	CTG	2	6	13217	13222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444220
266	NC_011080	GAA	2	6	13244	13249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444220
267	NC_011080	TGA	2	6	13270	13275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444220
268	NC_011080	CAG	2	6	13400	13405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444220
269	NC_011080	GCA	3	9	13414	13422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444220
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271	NC_011080	AAC	2	6	13448	13453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194444220
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280	NC_011080	GGC	3	9	13845	13853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443702
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287	NC_011080	GCG	2	6	14053	14058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443702
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295	NC_011080	GTG	2	6	14577	14582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443702
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323	NC_011080	T	6	6	15798	15803	0 %	100 %	0 %	0 %	194445243
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382	NC_011080	A	6	6	19584	19589	100 %	0 %	0 %	0 %	194443256
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386	NC_011080	GAT	2	6	19763	19768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443256
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390	NC_011080	GACCAT	2	12	20048	20059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194445060
391	NC_011080	A	6	6	20101	20106	100 %	0 %	0 %	0 %	194445060
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